Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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