Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms