Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnih3Q6ZWS4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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