Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms