Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Atp8b3Q6UQ17 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Atp8b3Q6UQ17 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Atp8b3Q6UQ17 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Atp8b3Q6UQ17 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Atp8b3Q6UQ17 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Atp8b3Q6UQ17 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b3Q6UQ17 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms