Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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