Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms