Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim37Q6PCX9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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