Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlhb9Q6PB60 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms