Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
BC061212Q6P8K3 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms