Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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