Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms