Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pram1Q6BCL1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms