Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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