Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Atg9aQ68FE2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Atg9aQ68FE2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Atg9aQ68FE2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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