Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2bQ64511 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2bQ64511 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms