Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Zfp248Q640N4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zfp248Q640N4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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