Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Ss18Q62280 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ss18Q62280 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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