Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lama3Q61789 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lama3Q61789 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lama3Q61789 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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