Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hes3Q61657 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms