Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms