Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasa3Q60790 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms