Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms