Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms