Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms