Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eme2Q56A04 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms