Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syne3Q4FZC9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syne3Q4FZC9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms