Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxn3Q499D0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms