Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2Q3V1H1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms