Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prdm6Q3UZD5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prdm6Q3UZD5 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prdm6Q3UZD5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prdm6Q3UZD5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prdm6Q3UZD5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prdm6Q3UZD5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Prdm6Q3UZD5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms