Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnpc3Q3UZ01 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms