Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kdm5aQ3UXZ9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Kdm5aQ3UXZ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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Kdm5aQ3UXZ9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kdm5aQ3UXZ9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms