Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms