Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms