Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms