Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms