Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms