Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b2Q3UJB0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms