Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms