Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll12Q3UDE2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttll12Q3UDE2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms