Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms