Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U595 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q3U595 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q3U595 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q3U595 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U595 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q3U595 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Q3U595 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Q3U595 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Q3U595 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U595 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U595 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms