Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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