Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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