Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kdm4dQ3U2K5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kdm4dQ3U2K5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms