Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms