Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms