Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hace1Q3U0D9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms