Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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