Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca4Q3TKT4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca4Q3TKT4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms